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医学知识库提供服务(医学知识库包含)不要告诉别人

2023-10-31Aix XinLe

截至2021年2月20日,OMAHA知识库已发布102万实体,587万三元组,其中语义类型包含临床所见、药品、操作、基因、基因突变、人体形态与结构等。

医学知识库提供服务(医学知识库包含)不要告诉别人

 

资源发布OMAHA已建立“七巧板”医学术语集、“汇知”医学知识图谱、元数据等资源,将于每月发布其中一项具体各项发布时间为:“七巧板”术语集于每季度第一个月20日发布, “汇知”图谱于每季度第二个月20日发布,元数据于每季度第三个月20日发布。

同时于2021年第一季度开始发布OMAHA知识库资源包OMAHA知识库发布时间与“汇知”图谱保持一致,为每个季度第二个月20号,敬请关注!开放医疗与健康联盟(Open Medical and Healthcare Alliance,OMAHA)是由浙江数字医疗卫生技术研究院发起的行业联盟,联盟旨在了解和梳理行业内从业企业的共同需求,将个别企业难以独立完成或难以取得短期经济效益的可共用、可复用的构件、组件、中间件,通过开放开源、众包协作的研发方式供联盟企业共同使用,从而降低单个企业的研发成本,提高行业产品的标准化规范化。

目前OMAHA联盟已向行业提供“七巧板”医学术语集和“汇知”医学知识图谱资源服务,为了使服务机构能够更便捷地合并使用“汇知”图谱及“七巧板”术语集资源,联盟于2021年第一季度开始发布OMAHA知识库资源包

。OMAHA知识库发布时间与“汇知”图谱保持一致,为每个季度第二个月20号,1年发布4次,并遵循“汇知”图谱发布文件规范。

截至2021年2月20日,OMAHA知识库已发布102万实体,587万三元组,其中语义类型包含临床所见、药品、操作、基因、基因突变、人体形态与结构等,具体语义类型分布情况见图1:

图1:OMAHA知识库语义类型分布情况OMAHA知识库包含最新版“汇知”图谱及“七巧板”术语集数据,针对其中复杂程度高且难以通过简单三元组表达的医学知识,采用定义关系组的方式来实现知识的完整表达例如将实体“多发性一过性白点综合症“的两条关系 “发生部位”和“形态学改变”形成关系组,从而实现医学知识“多发性一过性白点综合症是炎症且发生部位是视网膜”的明确表达,具体示例见图2:。

图2:多发性一过性白点综合症三元组示例同时,为了让用户更直观的了解OMAHA知识库的内容,减少理解成本,联盟开发了OMAHA知识库可视化工具用户通过检索实体即可查看该实体相关的所有三元组此外,OMAHA知识库可视化还支持属性关系和属性值语义类型的筛选。

以搜索“盐酸二甲双胍”为例,登录HiTA平台后,点击“OMAHA知识库可视化”,在搜索框中输入“盐酸二甲双胍”,下拉框会展示以该关键词开头的实体,如图3:

图3选择语义标签为“药品”的“盐酸二甲双胍”实体,界面就会展示出以该实体作为属性域的所有三元组,如图4:

图4通过筛选右侧栏的属性关系和属性值语义标签查看三元组。例如,检索“盐酸二甲双胍”的“用药目的”和“适应证”关系,如图5:

图5当属性值背景色为浅蓝色,表示该三元组与其他三元组不成组。若属性值为其他颜色则表示该三元组与其他三元组成组表达,且相同颜色为同组。如图6:

图6OMAHA知识库服务获取方式1. 登录HiTA服务平台( hita.omaha.org.cn )。

2. 点击知识库→OMAHA知识库,即进入OMAHA知识库下载界面。

3. 点击知识库→OMAHA知识库可视化,即可进入OMAHA知识库可视化检索界面。

目前OMAHA知识库资源暂仅对联盟高级版服务机构开放如果您还不是OMAHA服务机构可以通过HiTA平台下载样例数据进行了解,或直接联系我们:HiTA 服务:hita@omaha.org.cn数字医学知识中心负责人 徐美兰:。

meilan.xu@omaha.org.cn相关推荐:【2月发布-知识图谱】首次发布“疾病临床表现”、“中毒”知识图谱及OMAHA知识库【1月发布-术语集】标准术语资源结构化上线,实现资源高效利用 开放共享 | 新型冠状病毒肺炎诊疗知识图谱

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